De beproeving van de Jedi is een nieuw deel in de Star Wars Kloonoorlogen en vormt een schakel tussen de films Episode II - Attack of the Clones en Episode III - De wraak van de Sith. Door een gebrek aan ervaren Jedi worden de jonge Anakin Skywalker en de in ongenade gevallen Neeja Halcyon aan het hoofd van een klein leger klonen naar de planeet Praesitlyn gestuurd. Praesitlyn, waar het Intergalactische Communicatie Centrum van de Republiek gevestigd is, wordt aangevallen door droïdes van de Seperatisten onder leiding van admiraal Pors Tonith. Anakin moet de bevelhebber op de planeet, kapitein Zozridor Slayke, helpen de planeet koste wat kost voor de Republiek te behouden. Een harde, bloedige strijd volgt en omdat de verdedigers veruit in de minderheid zijn is het aan Anakin om het verschil te maken...