Gebaseerd op de populaire tv-serie Bones Temperance Brennan moet al haar werk opzijleggen wanneer ze door special agent Seeley Booth wordt gevraagd hem te helpen in een bizarre zaak. Booth is bezig met een onderzbek naar van Chicago's grootste maffiafamilies, als er een plastic zak vol botten wordt gevonden, met daarop een briefje bevestigd met een grimmige boodschap. Tempe stelt vast dat het om botten van verschillende personen gaat, wat zou wijzen op het werk van een seriemoordenaar. Al snel wordt er een verdachte opgepakt, maar Tempe gelooft niet dat de zaak hiermee is afgedaan. Terwijl het onderzoek naar de maffiafamilie steeds gevaarlijker wordt en een bloederige wending neemt, probeert Tempe het mysterie achter de botten te ontraadselen. En daarmee brengt ze veel meer teweeg dan ze ooit had kunnen vermoeden…