In de zeventiende eeuw komt na een aanvankelijke bloei­periode een eind aan het rooms-katholicisme door de zeer wrede vervolging van priesters en gelovigen. De Portugese priester Sebastian Rodrigo begeeft zich op een levens­gevaarlijke speurtocht naar zijn oude leermeester Ferreira, die naar verluidt zijn geloof heeft afgezworen. De ont­moetingen met Japanse christenen en hun nietsontziende vervolgers hebben ingrijpende gevolgen voor het leven van de jonge priester.