Volgens acteur Matt Damon, regisseur Paul Greengrass en producent Doug Liman overtreft deze film hun eerdere Bourne-hits. Met een bizarre moord keert een gevreesde terrorist terug in David Webbs leven. Met tegenzin neemt Webb weer het alias 'Jason Bourne' aan. Zijn lokaas is de Medusa Brigade, een misdaadsyndicaat dat tijdens de Vietnamoorlog werd opgezet door corrupte officieren. The Bourne Ultimatum is het vervolg op Ludlums meesterwerk van paranoia, The Bourne Supremacy. De "Jason Bourne"-boeken behoren tot Ludlums beste en populairste werk.