De film vertelt het verhaal van de twaalfjarige Storm Voeten, zoon van drukker Klaas Voeten, die in het geheim verboden lectuur drukt. Als Klaas door de Inquisitie wordt betrapt tijdens het drukken van een belangrijke brief van Maarten Luther, wordt Storm ongewild het middelpunt van de jacht op deze brief. Bedreigd door de Inquisitie en geholpen door Marieke, een katholiek weesmeisje uit de ondergrondse tunnels, moet Storm in een race tegen de klok zijn vader zien te redden van de dood als ketter.